La Maestría es transversal a todas las ramas de las ciencias y las ingenierías, un programa de postgrado en M&S puede extender su campo de acción a una amplia gama de las ciencias fundamentales y aplicadas, y de las diferentes disciplinas en Ingeniería.
Campo de sistemas naturales:
a) Línea en sistemas ecológicos y ambientales
b) Línea en sistema climático
c) Línea en sistemas biomecánicos
d) Línea en sistemas moleculares
Campo de sistemas y procesos de ingeniería:
a) Línea en simulación, optimización y control de procesos
b) Línea en Automatización y Sistemas Mecatrónicos
c) Línea en análisis y tratamiento de información
Campo de Sistemas sociales:
a) Línea en optimización económica
b) Línea en modelos matemáticos para sistemas y redes socio-técnicas y socio-económicos
c) Línea de profundización de modelos para el aprendizaje